第五年的春季正月庚辰日，皇上颁布谕令，对于那些已故的功臣，如果没有后代，他们的家产将给予其妻子自行赡养。壬午日，红衣大炮铸造成功，大炮上刻有“天佑助威大将军”的字样。这也是军队中开始制造大炮的起点。乙未日，皇上任命额驸佟养性为总理，负责汉人军民事宜，汉族官员都要听从他的节制。己亥日，皇上亲自来到文馆，进入库尔缠直房，询问正在编纂的是什么书籍。得到的回答是：“正在记录行政事务。”皇上听后说：“既然如此，那么我就不适合观看。”随后，皇上又翻阅了达海所翻译的《武铨》，看到其中记载的投醪饮河的事情后，他说：“古代的良将能够体贴士卒，因此全军将士都愿意为他们效死。但如果像额驸顾三台那样，在对敌时看到战士阵亡，只是用绳子拖回来，又怎么能得到士兵的全力效忠呢？”庚子日，朝鲜的贡物没有达到规定的数额，皇上拒绝接受，并以书信的形式责备了朝鲜的过失。

二月庚申日，皇上命令边境的官员要谨慎地设置哨所和警戒线。甲戌日，孟阿图出征瓦尔喀并传来了捷报。

三月乙亥日，也就是这个月的初一，镶蓝旗的固山额真、额驸顾三台被罢免，由太祖的弟弟的儿子篇古来替代他。皇上还写信给大贝勒代善、三贝勒莽古尔泰以及各位贝勒大臣，希望他们能够直言不讳地指出皇上的过失。丁亥日，皇上检阅了汉族士兵。甲午日，刘兴祚、兴治的家属被诛杀，但他们的母亲被赦免。丁酉日，朝鲜再次派遣使者前来进贡。辛丑日，皇上派遣满达尔汉、董讷密给朝鲜国王送去书信，请求他们提供战船以协助攻打明朝，但朝鲜并未答应。

六月癸亥日，皇上确定了功臣的袭职制度。黑龙江的伊札讷、萨克提、伽期讷、俄力喀、康柱等五位头目也前来朝见。

秋季七月的甲戌日，黑龙江的虎尔哈部的四个头目前来朝见并献上贡品。庚辰日，开始设立六部，任命墨勒根戴青贝勒多尔衮，以及贝勒德格类、萨哈廉、岳讬、济尔哈朗、阿巴泰等人管理六部事务。每个部门都分别设置了满、汉、蒙古的承政官，其下各有八位参政，还有一位启心郎。同时，将巴克什的职务改为笔帖式，而那些仍被称为巴克什的人则保留原职。更改了关于讦告各贝勒并准其离主的规定，禁止因小事而讦告。还谕令贝勒在审理案件时，若存在冤屈和不公，将受到惩罚。废除了对所有有罪职官一律削职的律法，今后将根据罪行的轻重进行不同程度的处罚。同时，禁止官民之间同族嫁娶，违反者将按奸淫论处。还谕令贝勒及各位大臣反省并改正自己的行为，寻求忠言谏诤。甲申日，闹雷虎尔哈部的四个头目也前来朝见并献上贡品。癸巳日，确定了小事赏罚的条例，命令牛录额真审理小事，大事则送交六部处理。明朝的总兵祖大寿等人在大凌河筑城。皇上下令各蒙古部落率领自己的部众前来会合，准备征讨。己亥日，大军向西出发，命令贝勒杜度、萨哈廉、豪格留守。庚子日，大军渡过辽河，皇上告诫将领们要体恤士卒。

八月壬寅日，是当月的初一，大军在旧辽河附近扎营，蒙古各部也率兵前来会合。癸卯日，皇上召集蒙古各贝勒，重申之前的命令，禁止擅自杀掠。随后，大军分为两路，贝勒德格类、岳讬、阿济格率领两万兵力从义州进入，屯驻在锦州和大凌河之间，而皇上则亲自从白土场进入广宁。丁未日，两路大军在大凌河会合，并趁夜攻城。皇上命令说：“攻城可能会伤及士卒，我们应当挖掘壕沟，构筑堡垒来困住他们。如果他们出城，我们就与他们交战；如果他们的外援到达，我们就迎击他们。”于是，八旗军队分头合围，让蒙古军队填补空隙。辛亥日，明朝的马步兵五百人出城，被达尔哈击败。壬子日，城中射出一封书信，招降蒙古人。癸丑日，明朝军队出城诱战。图赖首先冲入城内，达尔哈紧随其后，大军四面环攻，贝勒多尔衮也率领军队进入。城内的炮火和箭矢齐发，图赖受伤，副将孟坦、屯布禄、备御多贝、侍卫戈里在战斗中阵亡。皇上因为图赖等人轻率进攻而严厉责备了他们。随后，使用红衣大炮攻击明朝的了望台，城内士兵纷纷投降。乙卯日，皇上给祖大寿写了一封信说：“过去我想和你们议和，但你们君臣以宋朝为鉴，没有回应我。你们的国家不是宋朝，我也不是金国，为什么如此不通达事理呢？我现在厌倦了战争，再次写信给你们，希望将军能够裁决。”祖大寿没有回应。丁巳日，明朝松山的两千援兵到来，被阿山、劳萨、土鲁什击败。甲子日，贝勒阿济格、硕托拦截并击败了明朝的援兵。丁卯日，明朝锦州的六千士兵前来攻击阿济格的营地。当时正好大雾弥漫，双方士兵面对面都看不清对方。忽然有一阵青气冲向敌军营地，就像打开了一扇门，我军趁机冲进雾中，与敌军展开激战，最终击败了他们，擒获了一名游击将军，并缴获了他们的全部甲胄、武器和马匹。辛未日，皇上亲自前往贝勒阿济格的营地，用金杯酌酒慰劳各位将领。明朝军队突然冲出，我军两面夹击，再次大败他们。

九月丁亥日，皇上率领军队向锦州进军。当他看到尘土飞扬时，便命令全军暂停前进，亲自率领摆牙喇兵二百人，与贝勒多铎沿山悄悄前进。明朝锦州的七千士兵突然冲出来进攻皇上。皇上刚刚穿上盔甲，随从的人不到二百人，就渡河冲入敌军之中。敌军无法抵挡，纷纷溃败逃跑。其他军队随后赶到，再次大败敌军，斩杀了一名副将后返回。己丑日，皇上再次写信招降祖大寿。庚寅日，皇上在山内设下伏兵，引诱祖大寿出城，打算擒获他，但祖大寿惊觉后逃走，从此闭城不出。当时城中粮食仅剩下百石，马匹全部死亡，只能煮马肉为食，甚至用马鞍代替炊具。乙未日，明朝的太仆寺卿监军道张春，总兵吴襄、钟纬等人，率领马步兵四万前来救援，在小凌河扎营。戊戌日，明朝的援兵向大凌河进发，距离城池十五里。皇上率领两翼骑兵冲击敌军，但敌军并未动摇。右翼军队突然冲入张春的营地，敌军随即溃败，吴襄及副将桑阿尔寨率先逃跑。张春等人又集合溃散的士兵重新扎营，恰逢大风，敌军乘风纵火，火势即将蔓延到我军，但突然天降大雨，风向反转，我军再次与敌军交战，最终大败敌军，生擒了张春及副将三十三人。张春不肯屈服，请求赐死，但皇上赦免了他，没有杀他。这次战役中，祖大寿仍然以为我们是诱敌之计，所以城中没有人响应。当晚，黑云龙逃走。